Im Jahre 1704 ließen vier Partenkirchner Bürger aus alten Geschlechtern ihrem Schutzpatron, dem hl. Antonius von Padua, eine Kapelle erbauen. Dies geschah zum Dank für die Bewahrung in den Kriegsnöten des Spanischen Erbfolgekrieges, dessen Grausamkeit das ganze Loisachtal zu spüren bekommen hatte. Der Garmischer Maurermeister Fabian Mayr errichtete die Kapelle in der Form eines Oktogons mit einem rechteckigen, nordwärts vorgelagerten Altar. Vom Freisinger Fürstbischof Johann Franz Eckher zu Kapfing und Lichteneck wurde die Kapelle 1708 geweiht.

Pfarrer Matthias Samweber von Partenkirchen strebte aus pastoraler Sorge wegen der wachsenden Anzahl der Pilger die Erweiterung der Kapelle zu einer Kirche und den Bau eines Priesterhauses mit finanzieller Unterstützung seiner Schwestern und seines Bruders an. Den besten Künstlern ihrer Zeit wurden die Arbeiten für den Erweiterungsbau (1734 – 1736) übertragen.

Dem genialen Baumeister Josef Schmutzer aus Wessobrunn wurden die Umgestaltung und der Neubau anvertraut. Schmutzer ließ das Oktogon durchbrechen und fügte nach Süden den ovalen Kirchenraum an. Dabei entstanden seitlich zwei Rundkapellen. Der Altarraum wurde nördlich an das Oktogon angefügt und über ihm der geometrisch fein gegliederte Turm errichtet. Das Oktogon und das neue Kirchenschiff wurden unter einem durchgehenden Dach zusammengeschlossen und alles, was Schmutzer gelungen war, ergab nun das geschlossene Bild der Wallfahrtskirche St. Anton. Im Anschluss daran wurde nach Norden hin das Priesterhaus errichtet. Neben Josef Schmutzer arbeitete auch sein Sohn Franz Xaver in St. Anton. Ihm verdankt die Decke des Oktogons den in den zarten Grundfarben rosa, gelb und silbergrau gehaltenen, besonders reizvollen Rokoko-Stuck.

Die Kriegergedächtnistafel sind keine "Heldenverehrung", sondern traurige Erinnerung an liebe Menschen, die im 1. oder 2. Weltkrieg ihr Leben lassen mussten.